我司郑云课题组领衔的一项研究于2016年5月26日发表于国际著名期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research，2014年影响因子9.1）。
microRNA是一类具有重要调控功能的非编码小RNA。microRNA在生物发育过程和癌症等人类重要疾病中起到了关键的调控作用。在microRNA分子上存在各种由于DNA突变或RNA编辑引起的序列改变，这些改变会影响microRNA前体的稳定性或microRNA识别靶基因。小RNA深度测序数据，通常包含上百万或千万条RNA序列，包含了突变或编辑过的microRNA。在保持高度的灵敏性和较低的假阳性的基础上，从大量的测序数据中找到microRNA的编辑和突变非常困难。
研究中，郑云课题组提出了一种新的算法（MiRME），该算法采用了一系列高效的计算步骤，同时保持了高灵敏性和低假阳性率。研究分析了70个人类小RNA测序数据，从中发现了数以千计的显著的miRNA编辑和突变位点，包含位于miRNA末端的编辑事件、57个已经知道的一种称为A-to-I(G)编辑的位点（其中32个为首次发现）、以及一些未报道过的其他类型的编辑位点。通过结合基因组测序数据，该研究证明一些未报道过的其他类型的编辑位点不是由于基因组的突变导致，暗示存在其他类型的RNA编辑机制，进一步地扩展了miRNA的功能。该研究也比较了MiRME和6个已经发表的研究或方法，详细的比较结果显示MiRME的表现全面超越了其他研究或方法。
公司信息与自动化学院、澳大利亚悉尼科技大学、公司灵长类转化医学研究院也参与了该项研究。
(论文网址：http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2016/05/26/nar.gkw471)
